Помимо антропогенной нагрузки река подвергается действию специфических режимов: длительный ледостав, короткий вегетационный период, низкая концентрация кислорода и т.д. Это могло повлиять на видовой состав фитопланктона и функционирование водоема в целом. К тому же, короткое лето, особенности гидрологического режима (длительный ледостав, растянутое весенне-летнее половодье, преимущественно снеговое питание с заболоченных водосборов) определяет гидрохимические особенности рек таежной зоны Западной Сибири, в том числе и Оби: высокая цветность, пониженные значения рН, высокие концентрации аллохтонного вещества, соединений железа, дефицит растворенного кислорода и т.д.